Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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