Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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IFT88Q13099 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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