Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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