Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM2Q13029 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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