Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms