Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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