Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXC1Q12948 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXC1Q12948 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FOXC1Q12948 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FOXC1Q12948 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXC1Q12948 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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