Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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