Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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BPTFQ12830 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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BPTFQ12830 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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BPTFQ12830 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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