Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF5Q12774 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
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