Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms