Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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