Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP7AQ04656 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms