Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms