Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POU5F1Q01860 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms