Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF5P84085 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF5P84085 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF5P84085 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF5P84085 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF5P84085 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF5P84085 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF5P84085 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms