Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMF1P82094 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMF1P82094 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMF1P82094 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMF1P82094 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms