Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNA1P78396 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms