Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SH3BP2P78314 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP2P78314 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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