Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.5 ms