Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms