Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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