Protein–RNA interactions for Protein: P59910

DNAJB13, DnaJ homolog subfamily B member 13, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB13P59910 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJB13P59910 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms