Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA4P51532 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA4P51532 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA4P51532 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA4P51532 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms