Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRE11P49959 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MRE11P49959 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms