Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms