Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms