Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms