Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms