Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCAMP43121 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MCAMP43121 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCAMP43121 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCAMP43121 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCAMP43121 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCAMP43121 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCAMP43121 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCAMP43121 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCAMP43121 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCAMP43121 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCAMP43121 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCAMP43121 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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