Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF5P43026 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms