Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A1P43005 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms