Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms