Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMPK1P30085 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms