Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABRB3P28472 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms