Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PTPRZ1P23471 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PTPRZ1P23471 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PTPRZ1P23471 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PTPRZ1P23471 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRZ1P23471 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1P23471 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms