Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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