Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPREP23469 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms