Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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