Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms