Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1BP22528 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms