Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT1P21579 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT1P21579 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYT1P21579 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT1P21579 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms