Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms