Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
C8orf88P0DMB2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms