Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLBP06746 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLBP06746 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLBP06746 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLBP06746 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLBP06746 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLBP06746 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLBP06746 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLBP06746 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLBP06746 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLBP06746 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms