Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTCP00480 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTCP00480 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms