Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SEC24DO94855 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC24DO94855 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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