Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEBLO76041 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEBLO76041 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms