Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP290O15078 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP290O15078 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP290O15078 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP290O15078 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP290O15078 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP290O15078 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP290O15078 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP290O15078 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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