Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms